Налоговый кодекс РФ регулирует только порядок оформления и выставления счетов-фактур, но не содержит указаний о порядке внесения в них изменений. Пунктом 29 Правил ведения журналов учета полученных и выставленных счетов-фактур, утвержденных Постановлением Правительства РФ от 02.12.2000 N 914, установлено, что при обнаружении нарушений порядка составления продавцом счета-фактуры исправления вносятся в данный счет-фактуру. Прямого запрета на перевыставление счета-фактуры в указанных Правилах нет, Минфин считает, что повторное выставление счета-фактуры с исправлениями, заверенными в соответствующем порядке, неправомерно.
Основываясь на позиции финансового ведомства, можно сделать вывод, что в вычете, право на который подтверждено подобным счетом-фактурой, вероятно, откажут.
Отметим, что ранее Минфин России уже высказывал данную точку зрения (Письмо от 08.12.2004 N 03-04-11/217), есть также судебные решения, подтверждающие его позицию, однако противоположной судебной практики намного больше.

(по материалам Консультант Плюс)